Universitas Prof Dr Moestopo (Beragama) sudah sangat populer pada saat ini. Kepopuleran Universitas ini mulai dari kasus salah seorang mahasiswinya "Maharani Suciyono" ketika sedang bersama tersangka KPK yang terkangkap tangan pada saat kasus impor sapi pada beberapa tahun kebelakang.
Program yang tersedia di Universitas Moestopo Beragama Tahun 2014 ini, antara lain:
- Fakultas Kedokteran Gigi Universitas Prof. Dr. Moestopo (Beragama)
- Fakultas Imu Sosial dan Ilmu Politik. Konsentrasi: Manajemen Pelayanan Publik, Otonomi Daerah, dan Manajemen Penanggulangan Bencana.
- Fakultas Ekonomi: Konsentrasi: Management Pemasaran (mengedepankan pada E-marketing dan E-business), Management Keuangan (mengedepankan pada pasar modal dan keuangan syariah), Management sumberdaya manusia (memiliki kemampuan dibidang perencanaan, selection, training nasional, maupun global), Management Produksi (Khusus pada supply chain management)
- Fakultas Komunikasi
- dan, Program Pasca Sarjana Magister Manajemen